自然资源部南海生态中心联合有关单位及科创平台发布《黄岩岛珊瑚礁生态调查报告》显示，黄岩岛国家级自然保护区范围内造礁石珊瑚平均覆盖率高达 38.8%，分布有造礁石珊瑚 13 科 36 属 135 种，黄岩岛珊瑚礁生态系统状况总体良好。《黄岩岛珊瑚礁生态调查报告》指出，设立国家级自然保护区有利于实施更加科学的主动保护和生态修复，更好地维持和提升该区域珊瑚礁生态系统的多样性、稳定性和持续性。